南澳县海防史博物馆位于后宅镇中兴路。为广东省唯一县级海防史专题博物馆。1983年5月4日，南澳县人民政府发文成立“南澳县海防史博物馆”。股级事业单位，隶属县文化广电旅游体育局，县财政全额拨款。今编制4人。为五层框架结构，总建筑面积3300平方米。二、三层为主展厅“南澳海防史” 陈列，面积512平方米。四层为“直挂云帆济沧海——南澳Ⅰ号明代古沉船出水文物陈列”专题陈列展厅，面积750平方米，展出出水文物共1500件。一层为临时展厅，面积为276平方米，二、三层、五层各有文物库房，面积共296平方米。馆目前馆藏文物及艺术品达一万余件，其中馆藏文物721件，二级文物7件，三级文物162件。主陈列为“南澳海防史”陈列。展带长162.57米。展出有关兵防史料、出土军事实物、军事遗迹照片、历史文献照片186张，历史资料影印件53件、地图10件、绘画15幅及表14张，文物近200件，还有一批雕塑、半立体景箱以及南澳海防设防立体模型、海战、炮台、南澳城等全景。再现了南澳海防历史风貌。一层临时展厅展厅每年平均举办四个临时展览，从2004至2023年共举办65个临时展览。