曹县博物馆原名曹县商都博物馆，成立于2007年8月，2021年5月更名为曹县博物馆，坐落于县文化中心，隶属于县文化和旅游局。该馆是一处集收藏、陈列、研究、社会教育于一体的综合类博物馆，常年免费对外开放，在传播曹县地域文化方面发挥了重要作用。馆内藏品1724件（套），其中一级文物3件，二级文物4件，三级文物147件（套）。建筑面积4000余平方米，展室面积2000平方米，展陈“曹县历史文化展”，展品200余件，分为石器、陶器、青铜器、瓷器、玉器、字画、革命文物七大类。2014年该馆被菏泽市委宣传部批准为市级爱国主义教育基地。2017年，馆内开辟专门区域打造了文创展厅，展示特色文创产品。2024年被中国博物馆协会评定为“国家二级博物馆”。 自2007年免费开放以来，除基本陈列外，曹县博物馆还积极举办多个临时展览和“5.18国际博物馆日”、“文化和自然遗产日”等重要宣传活动，并着力开展“流动博物馆”进学校、进社区、进农村等宣传教育活动，吸引广大群众参观学习，年接待观众20万余人次。