1951年1月南靖县人民教育馆改为南靖县人民文化馆，兼管文物工作。1952年6月，县拨款将山城忠烈祠改建为县文化馆，面积120平方米。1980年，国家拨款25万元，在县城东建起新文化馆大楼，总面积2396平方米，内设文物室、展览馆等。1985年10月20日，南靖县成立文物管理委员会，下设办公室，成员由各单位临时组成，地点在文化馆，负责开展经常性文物调查、采集、考证、建档、维护管理及宣传展览等活动。 1993年6月由南靖县人民政府批准成立南靖县博物馆，隶属南靖县文化体育新闻出版局，属文物收藏、保护、研究、展示机构，办公地点在南靖县山城镇兰陵路11号图书馆四楼，自1992年1月始免费对外开放接待观众。 2010年6月，南靖县博物馆搬迁至文化中心圆楼，改变了无馆址的历史。