巫山博物馆馆藏文物28262件（套），其中珍贵文物1471件（套）；内设1个基本陈列、2个临时展厅和3个专题展览，基本陈列《巫山巫水巫文化》、专题陈列《长河遗珍》被评为重庆市十大精品展。 基本陈列《巫山巫水巫文化》以龙骨坡文化、大溪文化、巫文化为主线，完整的展示大巫山地区独特的历史文化；专题展《长河遗珍》以馆藏精品为基础，分别展示县内出土的西王母柿蒂形鎏金铜牌饰、庖厨俑、谷纹玉璧等精品文物；《灵山毓秀》立足于三峡文物抢救、保护的成果，从商周到明清，展示巫山辉煌的历史及厚重的文化积淀；“巫山县非物质文化遗产展示厅”是集非遗宣传、现场体验、免费观演、休闲娱乐等于一体的文化沙龙阵地。 巫山博物馆先后荣获“全国文物系统先进集体”、“国家二级博物馆”、“国家AAAA级旅游景区”、“重庆市科普基地”、“重庆市爱国主义教育基地”、“重庆市中小学校外科普特色基地”、“巫山县青少年科普教育基地”等称号。 目前，建筑面积6700㎡的巫山博物馆二期工程主体建筑已完成，拟围绕巫山县艺术电影成就、民俗节庆礼仪、生态环境优势和研学游活动策划展览。