1937年7月，抗日战争全面爆发，华北广大地区相继沦陷，北京大学、清华大学、南开大学被迫南迁。同年10月，三校合并组成“国立长沙临时大学”。由于局势持续恶化，1938年4月，“国立长沙临时大学”迁至昆明，更名为“国立西南联合大学”。抗战胜利后，西南联大于1946年解散，三校分别迁回北京、天津复校。 哥胪士洋行的本体建筑的修缮、馆内的陈列布展和外围的环境整治于2010年开始逐步实施。共投入资金640万元，修缮面积1862平方米，布展面积1100平方米。2010年7月，哥胪士洋行本体建筑修缮工程动工，10月竣工验收。共完成：屋面、墙体、大木作、小木作、门窗、地面、油饰、二层楼楞、楼板加固等项目修缮。哥胪士洋行的环境整治工程于2010年12月竣工。在修缮哥胪士洋行本体建筑的同时，开展西南联大蒙自分校纪念馆的陈列布展工作。陈列展览分为四个部分八个展厅：联大历史记、蒙自分校记、联大人才记、联大精神记等。纪念馆于2010年12月完成陈列布展工作，2011年1月试开馆，2011年9月正式向社会免费开放。