西南医科大学附属中医医院2015年8月在第二住院大楼第22层建设了中医药文化博物馆·院史博物院，该博物馆建筑面积约2000平方米，共投资总计4000余万元，免费对公众开放。博物馆藏品总数283件，文物类别包含18大类。整体保存较好。采取民间征集与老专家捐赠相结合的方式征集文物，陈列物品包含了历史文物、绘画、雕塑等艺术品，如玻璃器、瓷器、档案文书、古籍图书、家具、金银器、名人遗物等。具有极高的历史价值、文化价值、科学研究价值。主要分为两个展区，分别为中医药文化发展史展区和医院发展史展区。中医药文化发展史展区共分为六个部分展示中医药文化的发展历史：一是医药起源、二是基础理论、三是内外疗法、四是医药学术、五是历代名医、六是中医养生。共设有人员12名，其中在编人数11人，招聘人数1人，专业技术人员2人，内设机构7个。数字网络半球摄像头有7台，消火栓有11套，烟感探测器有56个，讯响器7个，手报按钮7个，起泵按钮11个，喷淋头176个，应急疏散指示灯13盏，干粉灭火器22具，防火门3樘，排烟设施2套。实现馆舍区域内监控管理无死角全覆盖，消防系统基本适应馆舍消防工作需求。