为有效发挥大学博物馆在人才培养、教学科研和文化传承方面的特色和优势，2018年，中山大学成立中山大学博物馆（校史馆）机构，并在广州南校园筹建中山大学博物馆新馆，将建成集教学、展示、研究、收藏为一体，充分彰显中山大学历史和文化的高水平综合性博物馆。博物馆（校史馆）现有场馆包括博物馆、校史馆、生物博物馆、医学博物馆、人类学博物馆、名人故居等。其中，博物馆、校史馆于2024年11月9日开馆。 博物馆位于南校园中轴线西侧，占地面积约1.1万平方米，总建筑面积约3.3万平方米，地上建筑3层，地下建筑2层，主要以服务教学与人才培养为主线，深化教学教育改革，拓展文化育人内涵，促进大学文化建设。博物馆在外观设计上延续中山大学康乐园早期建筑群的风格，建筑立面运用红砖绿瓦以及中大传统建筑中窗、墙、柱、顶等代表性元素，充分体现了中山大学的建筑特色和内涵，与周边建筑相呼应并协调。同时，融入岭南建筑式样，运用拱券形成岭南建筑特有的室内外过渡空间，蕴含地方文化特色。目前已建成生命与健康教学展厅、陶瓷教学展厅和文物专题展厅，发挥高校博物馆教育教学、研究与公共文化服务的功能。 校史馆位于广州校区南校园格兰堂。格兰堂又称大钟楼，建成于1916年，按捐赠人意愿而命名，系康乐园早期建筑群的代表性建筑。2019年8月30日，中山大学校史陈列馆设于格兰堂一层。为迎接学校世纪华诞，格兰堂整体改造为校史馆，并于2024年11月9日正式开馆。校史馆建筑面积约2400平方米，二至四层为校史展览区，一层为校史文献收藏、研究等区域。校史馆是学校百年办学历程的集中展现，弘扬优秀的办学传统，传承中大文化精神，发挥校史育人作用，坚定中国特色社会主义文化自信。 生物博物馆由植物、动物、昆虫、化石标本馆组成，其中植物标本馆始于1916年的格致书院标本馆，有活体竹种标本园；动物标本馆建于20世纪20年代；昆虫标本馆前身是原岭南大学自然博物采集所昆虫标本馆。现保存具有鲜明华南地区动植物区系特点的标本约120万号，是生物多样性调查研究和生物学、生态学教学的重要平台，是国家级科普教育基地。室内展厅包括化石与生命演化展厅、综合展厅、脊椎动物生态展厅、鸟类与哺乳动物标本陈列室及水生动物标本陈列室，以及1个生命科学长廊。