1990年9月，山东省旅外侨团联谊会在香港举行成立大会，与会的世界各地山东侨团侨领一致倡议在山东济南建设永久会馆，作为联络接待海外侨胞基地。场馆建设于1993年启动，1994年封顶，2000年启用。2001年8月，省编办《关于成立山东华侨会馆的批复》，同意成立山东华侨会馆，为差额预算管理正处级事业单位，职能是承担旅外侨团的联络和服务及全省侨务干部的培训工作。2014年12月，省编办《关于省政府侨务办公室所属事业单位类别划分的通知》，批准山东华侨会馆为公益二类事业单位。2021年3月，省编办《关于印发省委统战部所属事业单位机构职能编制规定的通知》（鲁编办〔2021〕36号）确定：山东华侨会馆为省委统战部所属正处级公益一类事业单位，挂山东华侨博物馆牌子。主要职责是开展全省统战侨务干部研修培训;开展旅外侨团侨胞的联络、服务和救助;承担山东华侨博物馆的筹建和管理工作;开展国内外文博展览、交流与合作;开展侨史研究,承办华文教师培训、华裔青少年中华文化体验活动,支持海外中华民族节庆活动等。