博物馆前身为邹公祠，是清朝廷为镇压张秀眉起义战死的邹泗钟所建的纪念祠堂。修建于光绪年间，坐北朝南，是一座由三面高封火墙围成的四合院式古建筑，占地面积800平方米，建筑面积480平方米，展厅面积300平方米。1984年6月27日，被公布为第二批县级文物保护单位。为加强文物的保护利用，于1998年将邹公祠进行维修作为镇远展览馆使用，2006年6月被公布为省级文物保护单位。2011年12月被列入全国第三批免费开放单位，正式挂牌为镇远县博物馆。镇远县博物馆的陈列围绕镇远的“历史文化名城”为主题，通过图文并茂的形式向大家展出镇远的历史风貌。主要分为镇远的历史沿革、风土人情、文物状况、人文风光等几个方面，是镇远发展史的一个缩影。馆内由于安保条件达不到，故只展出了11件文物展品。