甘肃中医药大学博物馆下设中国医学史博物馆、中药标本馆、敦煌医学馆等展馆。自1986年建馆以来，累计投入资金总额达200余万元。现有建筑面积1450平方米，共展出标本、模型、图片近4000件（台），成为具有一定规模和水平的医学教育和科技教育基地。该馆不仅获得了全国普通高等院校优秀教学成果二等奖、省级一等奖，并于1999年被教育部、科技部、中共中央宣传部、中国科协评为“全国青少年科技教育基地”，2004年被甘肃省委宣传部评为“甘肃省爱国主义教育基地”，同年,被甘肃省教育厅、科技厅、省委宣传部、省科协评为“甘肃省科普教育基地”。2006年被评为“兰州市科普教育基地”。 医药文化博物馆陈列资料丰富，内容翔实，编排新颖。通过实物、彩图、照片、塑像、灯光等多元化手法，改变了以往专业展馆单调、枯燥的格局，集思想性、科学性、知识性、趣味性为一体，营造了一个生动活泼的科普课堂。