平阳文物保护机构组建于上世纪70年代初，当时由平阳展览馆、文物组组成。1985年正式成立平阳县文物馆，主要负责全县文物征集、展览、保护宣传等工作，其职能与博物馆相同，除具备博物馆的一些管理功能之外，主要承担地上地下文物保护管理、文物保护单位维修以及野外文物考古调查等。为适应新形势下文物保护发展的要求，2007年成立平阳县文物保护管理所，文物保护管理所成立后与县文物馆合署办公，实行两块牌子、一套人马。2009年县文物馆更名为平阳县博物馆，现平阳县文物保护管理所与平阳县博物馆继续合署办公，依然是两块牌子、一套人马，单位隶属、性质、编制均不变。2017年谢侠逊纪念馆归属平阳县博物馆，2020年苏步青励志馆归属为平阳县博物馆。 现平阳县拥有藏品1866件套，其中一级品3件。二级品23件，三级品29件，其余均为未定级文物。谢侠逊纪念馆藏品475件套均为未定级文物。苏步青励志教育馆藏品3440件套均为未定级文物。基本陈列有平阳县历史陈列，谢侠逊生平展、苏步青生平展。展厅面积共计约1600平方米。平阳县博物馆本馆及下属2个分馆均部署有安防设施。 平阳县博物馆为全额拨款事业单位。现有事业单位编制人员16名，在编人员14名，在馆工作实际9名，其中考古文博专业硕士研究生2名；编外工作人员12名，安保人员14名。