博物馆对外免费开放的主馆区位于城市广场，有“诸山毓秀 浣水流芳——诸暨历史文化陈列”和“陵谷沧桑 守望家园——诸暨自然陈列”，西施故里馆区有余任天纪念馆、寿崇德艺术馆，另有城西分馆——华夏金石学馆。主馆区基本陈列面积约2200平方米。“诸山毓秀 浣水流芳——诸暨历史文化陈列”由“浦阳江畔 文明之光”“越国古都 西施故里”“秦时置县 浙东巨邑”“浣水悠长 名贤之乡”四个单元组成。“陵谷沧桑 守望家园——诸暨自然陈列”由“大地初成 古邑天然”、 “诸山暨水 奇产所钟”两个单元和“印象诸暨 美哉自然”互动区组成。基本陈列再现诸暨六千多年的悠久历史和灿烂文化 ，浓缩了暨阳大地独特的自然地理环境。陈列以文物为主，结合场景、图片、模型、新媒体等形式，将数字化、体验互动、研学教育等融入其中，展现了一个历史悠久、钟灵毓秀、人文荟萃的诸暨，突出“越国古都、西施故里”的地域文化特色和深厚的人文底蕴。