连云港市赣榆区博物馆原名赣榆县博物馆，早期组建于1959年，1961年撤销。此后由图书馆、文化馆代管。1984年，文物管理工作移交普查办。1986年，在普查办的基础上重建赣榆县博物馆。2010年10月位于青口镇黄海东路新馆建成，免费对外开放。新馆建筑面积5500平方米，展厅面积3200平方米。2014年赣榆撤县设区改为连云港市赣榆区博物馆，主管部门为连云港市赣榆区文体广电和旅游局，股级事业单位。2024年定级为国家三级馆。 赣榆区博物馆基本陈列按照“一体两翼”模式布局。一体主要指以赣榆历史发展为主要展陈对象的《史纪》厅。该厅以赣榆2000多年的历史发展脉络为主线，突出秦汉文化主体，上溯夏商周，下延元明清。两翼是指《海韵》厅和《风情》厅两个展厅，主要展示赣榆地方的海洋文化和民俗文化。2021年，根据盐仓城遗址考古发掘出土的177件文物，择其精华，新开辟了《古城盐韵——盐仓城遗址出土文物专题展》。 赣榆区博物馆现有工作人员8人，硕士研究生1人，本科3人，大专4人，全额财政拨款7人，自筹人员1人。专业背景涉及历史学、文物修复等专业。文博高级职称2人，中级职称5人，助理级1人。 赣榆区博物馆建有中心控制室1处，展厅周界，库房均配置监控设备。建立了入侵报警系统、图像复核与视频安防监控系统、声音复核系统、门禁控制系统、电子巡更系统、电源与UPS备用电源系统、防雷接地系统和出入口管理系统等。