瓜州县博物馆成立于1988年4月，1994年9月建成新馆，占地面积5400平方米，建筑面积2772平方米，是一座地方性综合博物馆，是瓜州县地方历史和文化遗址的研究保护中心。主要业务有博物馆免费开放、宣传教育、馆藏文物收藏、保护、管理、研究、对县域非国有博物馆帮扶指导等业务及县委县政府安排的其他各项工作。 现有馆藏藏品2322件（套），其中建档文物2230件（套），其中一级文物13件，二级文物55件，三级文物117件，珍贵文物共有185件（套），一般文物2045件（套）。基本陈列为《古郡瓜州 丝路重镇》，2008年4月瓜州县博物馆正式免费向公众开放；2011年12月，被甘肃省委宣传部列为“爱国主义教育基地”；2021年5月，被酒泉市科学技术协会命名为 “酒泉市科普教育基地”；2021 年11月，被酒泉市文体广电和旅游局、酒泉市教育局认定为 “酒泉市中小学生研学教育基地”。2022年4月，被甘肃省科学技术协会命名为“甘肃省科普教育基地”。