甘肃敦煌阳关国家级自然保护区动植物标本展览馆有三个展厅。第一展厅为保护区基本情况，包括保护区概要，功能区划分，阳关保护区地理走势。第二展厅为沙盘，保护区两大主要保护对象；历年来环保部、省环保厅领导视察指导保护区工作的影像资料及近年来保护区工作人员在工作和学习中所收集的资料，包括总体规划、科考报告、保护区图册、论文集、调查报告集、阳关生态季刊等；保护区成立以来基础设施建设情况，包括新建管护站3个、检查哨卡4个、埋设围栏65公里、界碑200多个，大小宣传牌30多个；社区共建情况；封滩育林和防风固沙情况；野生动植物资源情况，其中共有脊椎动物145种，其中哺乳类35种，鸟类87种，鱼类7种，两栖动物2种，爬行动物14种，记录在册的昆虫40种，以及近期打捞出的一条长97cm，重29斤的野生草鱼标本。种子植物141种，被子植物2种。第三展厅是以山地、湿地、荒漠为主的模拟生境展厅，并对这三种模拟生境中典型动植物进行展示。动物标本包括苍鹰、沙狐、刺猬、灰斑鸠、红脚鹬、文须雀等111件。以及保护区中特有的湿地植物和荒漠植物所做成的蜡叶标本212件。