始建于上世纪六十年代，是新中国成立后建立的第一所关于中国传统医学发展的博物馆。开创了中国医学博物馆在高等中医药院校教学的先河；实践了王国维“文献、文物二重结合”研究医学史的方法；引领了全国医学史博物馆、中医药类博物馆建设以及全国中医药文化建设。 博物馆于1979年重建并定名为“陕西中医学院医史博物馆”，1991年由陕西省人民政府文物局命名为“陕西医史博物馆”，1992年被咸阳市旅游局定为旅游涉外定点单位，是全国中医院校中最早独立自主建设的医史博物馆。是陕西省中医药科普宣传教育基地（省社科联），是陕西省中医药文化宣传教育基地（省中管局）。2014年被评为全国中医药文化宣传教育基地。 馆藏历史文物丰富，各类材质器具类文物3000余件套，其中医药卫生类者1700余件。主体展览分为通史部分、专题部分、中医药碑林、医史文化展示以及五行园五部分。