汶上县博物馆为汶上县文化和旅游局下属副科级单位，事业编制，具有独立法人。目前，馆藏文物总数56557件(套)，上迄更生世第四纪新生代古棱齿象牙化石，下至近、现代文物，尤其是1994年3月15日太子灵踪塔地宫出土的精品文物成为馆藏文物的一大特色，在国内外享有盛名。其中，馆藏文物中珍贵文物共计99件（套）：一级文物有16件(套)，二级文物有17件(套)，三级文物有66件(套)。  汶上县博物馆基本陈列展共有1个，《汶上通史和佛教文化展》，展厅共两层：一层为汶上通史、运河文化、中都名人等，二层主要展出汶上太子灵踪塔地宫出土精品文物展示，以文殊般若碑、章仇氏造像碑等碑刻和水牛山摩崖石刻拓片、塔宫出土文物、流散佛教文物等。