南京市江宁区金陵佛教文化博物馆是经江宁区委编办江宁编字〔2015〕17号《关于设立南京市江宁区金陵佛教文化博物馆的批复》文件批准成立的全额拨款事业单位，隶属于南京牛首山文化旅游区管理委员会。金陵佛教文化博物馆设立了涵盖佛教文物等多个专题陈列区，主要分为三个展厅，分别为序厅、第一展厅、第二展厅，每个展厅都有其独特性及关联性。共有前言、佛教伽蓝、法融、牛头宗、塔基瘗藏及摩崖石刻、古迹名胜、历代文人墨客、诗歌与游记、后记九个部分。