晋城博物馆于2002年12月28日建成开馆。2009年被国家文物局评定为二级博物馆。2013至2014年，博物馆进行大规模的维修改造工程和展览提升工程。2020年机构合并，晋城博物馆与玉皇庙文物管理中心，青莲寺文物管理中心，晋城市文物研究所合并为晋城市文物保护研究中心（晋城博物馆）。 其中博物馆占地16186平方米，建筑面积11726平方米。共有9个展厅，面积2971平方米。现有馆藏藏品总数23744件，其中一级文物3件，二级文物213件（套），三级文物523件（套）。馆藏以明代出土陶质侍俑、建筑木构件以及装饰木雕砖雕为主系列。目前有《晋城古代文明》与《晋城古代建筑艺术》两个基本陈列。晋城市文物保护研究中心为公益一类事业单位，隶属于晋城市文化和旅游局。副处级建制，现有事业编制数81名，管理岗位16名，专业技术岗位65名，工勤岗位4名；其中领导职数4名，中心主任1名（副处级），副主任3名（正科级）。